Yugi Moto enseña a jugar el juego de las cartas a su amigo Joey. Al final de la lección, le dice a sus amigos que su abuelo tiene una tienda de juegos. Tristán le pide que vayan y Yugi acepta, diciendo que si tiene suerte su abuelo les mostrará una carta sumamente rara. Seto Kaiba escucha esto y decide seguirlos. Ya en la tienda, El abuelo les muestra la carta: El Dragón Blanco de Ojos Azules. Solo hay 4 como ellas en el mundo. Esa es la carta que Seto, campeón nacional en el juego de duelos, busca desde hace mucho. Le pide esa carta al abuelo a cambio de muchas cartas valiosas o por la cantidad de dinero que desee, pero el abuelo no acepta. Seto se retira, pero aún no se rinde.
Más tarde, cuando el abuelo esta sólo, recibe la visita de unos hombres de Kaiba, quienes le dicen que Kaiba lo reta a un duelo. El abuelo acepta. Más tarde, Yugi recibe una llamada teléfonica de Seto donde éste le dice que su abuelo jugó un duelo con él, pero que no se siente bien, así que le pide que vaya a recogerlo. Aparentemente, el abuelo sufrió algún tipo de herida durante el duelo, el cual perdió con Seto. Este se quedo con la carta del abuelo y la rompe frente a todos. Ellos se indignan y Seto reta a Yugi a un duelo. Todos le piden que acepte y le dé una lección a Seto. El duelo se lleva a cabo y rápidamente Yugi se entera de cómo perdio su abuelo: Seto tiene las otras 3 cartas del dragón blanco de ojos azules. Su estrategia de conseguir esa carta era únicamente para que nadie en el mundo pudiera usarla en su contra. Sin embargo, en la última jugada Yugi recuerda una de las lecciones del abuelo y con su mano de cartas invoca a Exodia, el único monstruo invencible dentro del juego de monstruos en duelo. Con Exodia vence fácilmente aún a los dragones de Seto.

Yugi le pide a Joey que le muestre su mazo de cartas y ve que tiene un predominio de monstruos, pero sin cartas de magia. Ante la gran inexperiencia de Joey, Yugi le indica que su abuelo podría ayudarle para aprender y dominar el juego. Una vez que el abuelo se convence de su real deseo de aprender, acepta someter a Joey a un rígido e intensivo entrenamiento.

Maximilian Pegasus, conocido como el inventor del juego de duelos de monstruos, se entera de la derrota de Seto y le envía a Yugi un video y un mazo para el duelo de monstruos. En el video Pegasus se presenta y lo reta a un duelo para conocer sus habilidades. A pesar de lo raro que suena jugar contra una cinta de video, Yugi acepta. Sin embargo, Pesagus usa magia para transportar a Yugi al mundo de las sombras, donde se efectúa el duelo. Durante el duelo, Pegasus le revela a Yugi que en realidad el juego fue inventado en el antiguo Egipto y que existen 7 objetos místicos que con el uso apropiado pueden liberar una considerable cantidad de poder. Le revela a Yugi que su pendiente, el rompecabezas del milenio que le dio su abuelo, es uno de esos. Ademas, Pegasus tiene otro de esos siete objetos. El duelo es muy parejo, y termina con una muy cerrada victoria para Pegasus, el cual sólo gana porque el límite de tiempo establecido lo salvó de lo que hubiera sido un ataque devastador de Yugi. Maximilian felicita a Yugi y lo reta a un nuevo duelo, pero ante la negativa de Yugi, Pegasus usa su poder para robar el alma del abuelo de Yugi para obligarlo a ir por él.

Yugi y los demás encuentran a Mai, la cual ha sido derrotada por Panic y ha perdido todas sus 8 estrellas. Panic es un eliminador pagado por Pegasus que se encarga de retirar a los jugadores débiles que se encuentran en su paso. Yugi reta a Panic a un duelo. Panic acepta, pero pronto le hace ver a Yugi cual es su táctica: la intimidación. Panic envuelve su parte de la arena en la obscuridad usando su carta del castillo de ilusiones obscuras de modo que el rival no sepa con qué lo están atacando. Yugi no se intimida fácilmente y le da pelea haciendo que Panic dude haciendo justo lo opuesto: le anuncia las cartas que va a poner, pero sin decirle cuando las va a poner. Yugi pone las cartas cara abajo de modo que Panic tampoco pueda ver las jugadas de Yugi y le dice que en cinco turnos lo derrotará.

Yugi usa las espadas de la luz reveladora y hace que la obscuridad termine. Le anuncia a Panic que le quedan tres turnos para perder. Panic eleva sus defensas, pero Yugi ya ha detectado la estrategia de Panic, así que obliga a panic a defenderse solamente, indicándole que mientras más se defienda más acrecentará su derrota. Mientras Panic esta ocupado defendiendo a sus monstruos, Yugi ataca al castillo de ilusiones obscuras, el cual se encontraba flotando sobre los fuertemente defendidos monstruos de Panic. Al caer el castillo, los monstruos no pueden huir debido a las defensas que no los dejan moverse y Panic es derrotado. Yugi devuelve a Mai sus estrellas, pero ella no las quiere aceptar por orgullo. Joey le pregunta si no aprendió nada de ese duelo y le dice que baje sus defensas y aprenda a confiar en sus amigos. Mai acepta las estrellas, pero le dice a Yugi que le pagará el favor.

Yugi y los demás se encuentran con Seto Kaiba y le piden que se reuna con ellos en su camino al castillo. Seto rechaza la oferta y se intenta retirar, pero Joey lo provoca a que tengan un duelo. Seto acepta con la condición de que lo hagan con el nuevo sistema holográfico de duelos basado en discos. Ese nuevo sistema permite tener duelos en todo tipo de terreno y tiene un notable realismo que incluso puede simular olores. Seto vence muy fácilmente a Joey y lo humilla. Los demás le reclaman su crueldad, pero él responde diciendo que si se quieren enfrentar a Pegasus no recibirían más cortesia de él.

Joey quedó tan impresionado con el realismo del nuevo sistema de duelos por hologramas que tiene pesadillas. Al despertar todos, ven que Mai se fue. Deja una nota diciendo a Yugi que le debe ocho estrellas. Al caminar en busca de nuevos duelos, Joey siente que alguien los sigue y decide investigar, alejándose de los demás. Llega a un lugar donde el Bandido Keith, Bouce y otro duelista lo retan a un duelo y lo llevan a un cementerio, llamado "la arena de las almas perdidas". Como Joey no acepta, lo provocan para que acepte. Molesto, Joey apuesta 4 estrellas. Bounce, el rival de Joey, se especializa en zombies, los cuales tienen un bono de campo en esa arena, pero siguiendo las órdenes de Bandido Keith lanza monstruos un poco más debiles que los de Joey y éste los derrota fácilmente. Sin embargo, en su siguiente turno los revive con la carta mágica "el llamado de los encantados" que revive a los monstruos derrotados como zombies y por lo tanto, susceptibles a recibir el bono de poder de la arena. Joey se encuentra en fuerte desventaja.

Joey se encuentra en desventaja y decide usar al mago del tiempo y lo comanda a atacar con la ruleta del tiempo. Desafortunadamente, Joey pierde en la ruleta y el tiro se revierte en su contra, quedando en peores condiciones. Después de otros turnos más, se encuentra aún peor. Yugi y los demás encuentran finalmente a Joey. Yugi le dice que tiene una carta que lo puede salvar. Joey la encuentra en su mazo y la usa. El poder de ataque de los zombies cae a cero, pero peor aún, como no tienen voluntad no se pueden defender en ese turno. Joey ataca y los destruye. Bandido Keith se molesta y sale de la cueva donde está la arena. Como Bandido Keith salió antes de la cueva, aprovecha para poner una roca enorme en la entrada e impedir la salida de Yugi y los demás. Después de eso, le quita las estrellas a sus compañeros para garantizar su entrada al castillo de Pegasus.

El amuleto del milenio de Bakura apunta a la ubicación de otros talismanes del milenio, asi que lo usan como brújula a traves de la cueva sabiendo que Pegasus tiene uno de ellos. Al poco tiempo llegan a una sala especial. Dos hermanos gemelos los reciben, son Para y Doja, dos de los eliminadores contratados por Pegasus. Les dicen que para poder avanzar, deben pasar por dos pruebas, la primera es un duelo en parejas y la segunda, es elegir una de dos puertas. Una los llevara a un laberinto sin fin y la otra es la salida al castillo de Pegasus. Les dicen que como ayuda pueden hacerles una pregunta, pero uno de ellos dirá siempre la verdad y el otro siempre dirá mentiras. Joey parece recordar como iba el truco, pero Yugi piensa que ambos mienten.

Seto se acerca al castillo de Pegasus, pero uno de los guardias de seguridad lo intercepta e intenta detenerlo. Sin embargo, Seto es muy fuerte y lo obliga a guiarlo al castillo de Pegasus. Mientras tanto, en el duelo de Yugi, los hermanos Para y Doja han empezado su ataque con una carta de laberinto en donde se efectuará el duelo. El laberinto cambia de forma a conveniencia de los hermanos, separando los guerreros de Yugi y Joey. La estrategia de los hermanos es atacar primero a Joey, ya que es el más débil. Para contrarrestr el ataque, Yugi usa su turno para atacar con la caja mística, la cual cambia posiciones entre el mago oscuro de Yugi y el rival, además de atacar fuertemente al rival. Jugada a jugada, los hermanos Para y Doja ensamblan a un monstruo del tipo de Exodia llamado "El guardian de la reja", un monstruo formado de 3 poderes elementales. Una vez ensamblado, los ataques y defensa de este monstruo son muy elevados. Mientras tanto, Seto se acerca donde tienen encerrado a su hermano. El guardia de seguridad activa una alarma mientras Seto llega con su hermano.